Protein–RNA interactions for Protein: P49766

Vegfb, Vascular endothelial growth factor B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfbP49766 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VegfbP49766 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
VegfbP49766 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VegfbP49766 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
VegfbP49766 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
VegfbP49766 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
VegfbP49766 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
VegfbP49766 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
VegfbP49766 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
VegfbP49766 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VegfbP49766 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
VegfbP49766 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
VegfbP49766 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
VegfbP49766 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
VegfbP49766 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VegfbP49766 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
VegfbP49766 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms