Protein–RNA interactions for Protein: P49764

Pgf, Placenta growth factor, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgfP49764 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PgfP49764 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
PgfP49764 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PgfP49764 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PgfP49764 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PgfP49764 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PgfP49764 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PgfP49764 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PgfP49764 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PgfP49764 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PgfP49764 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PgfP49764 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PgfP49764 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PgfP49764 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PgfP49764 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PgfP49764 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PgfP49764 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PgfP49764 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PgfP49764 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PgfP49764 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PgfP49764 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PgfP49764 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PgfP49764 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PgfP49764 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PgfP49764 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PgfP49764 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PgfP49764 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PgfP49764 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PgfP49764 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PgfP49764 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PgfP49764 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PgfP49764 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PgfP49764 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PgfP49764 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PgfP49764 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PgfP49764 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PgfP49764 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PgfP49764 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PgfP49764 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PgfP49764 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PgfP49764 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PgfP49764 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PgfP49764 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PgfP49764 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PgfP49764 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
PgfP49764 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PgfP49764 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PgfP49764 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PgfP49764 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PgfP49764 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PgfP49764 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PgfP49764 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PgfP49764 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PgfP49764 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PgfP49764 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PgfP49764 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PgfP49764 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PgfP49764 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PgfP49764 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PgfP49764 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PgfP49764 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PgfP49764 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PgfP49764 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PgfP49764 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PgfP49764 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PgfP49764 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PgfP49764 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PgfP49764 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PgfP49764 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PgfP49764 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PgfP49764 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PgfP49764 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PgfP49764 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PgfP49764 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PgfP49764 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PgfP49764 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PgfP49764 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PgfP49764 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PgfP49764 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PgfP49764 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PgfP49764 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PgfP49764 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PgfP49764 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
PgfP49764 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PgfP49764 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PgfP49764 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PgfP49764 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PgfP49764 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PgfP49764 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PgfP49764 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PgfP49764 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PgfP49764 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PgfP49764 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PgfP49764 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
PgfP49764 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PgfP49764 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PgfP49764 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PgfP49764 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PgfP49764 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PgfP49764 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms