Protein–RNA interactions for Protein: P49698

Hnf4a, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hnf4aP49698 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Hnf4aP49698 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Hnf4aP49698 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Hnf4aP49698 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Hnf4aP49698 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms