Protein–RNA interactions for Protein: P49194

Rbp3, Retinol-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp3P49194 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Rbp3P49194 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Rbp3P49194 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Rbp3P49194 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rbp3P49194 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbp3P49194 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbp3P49194 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms