Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rpl5P47962 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpl5P47962 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rpl5P47962 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rpl5P47962 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms