Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Cdkn1bP46414 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cdkn1bP46414 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cdkn1bP46414 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cdkn1bP46414 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms