Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
PtgfrP43117 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PtgfrP43117 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PtgfrP43117 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PtgfrP43117 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms