Protein–RNA interactions for Protein: P42859

Htt, Huntingtin, mousemouse

Predictions only

Length 3,119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HttP42859 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
HttP42859 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HttP42859 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HttP42859 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HttP42859 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HttP42859 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HttP42859 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HttP42859 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HttP42859 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HttP42859 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
HttP42859 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HttP42859 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HttP42859 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HttP42859 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HttP42859 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HttP42859 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HttP42859 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HttP42859 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HttP42859 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HttP42859 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HttP42859 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HttP42859 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HttP42859 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HttP42859 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HttP42859 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HttP42859 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HttP42859 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HttP42859 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HttP42859 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HttP42859 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HttP42859 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HttP42859 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HttP42859 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HttP42859 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HttP42859 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HttP42859 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HttP42859 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HttP42859 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HttP42859 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
HttP42859 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
HttP42859 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HttP42859 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HttP42859 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HttP42859 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HttP42859 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HttP42859 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HttP42859 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HttP42859 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HttP42859 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HttP42859 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HttP42859 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HttP42859 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HttP42859 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HttP42859 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HttP42859 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
HttP42859 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
HttP42859 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HttP42859 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HttP42859 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HttP42859 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HttP42859 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HttP42859 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
HttP42859 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HttP42859 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
HttP42859 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HttP42859 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
HttP42859 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HttP42859 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HttP42859 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HttP42859 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HttP42859 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HttP42859 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HttP42859 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HttP42859 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HttP42859 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HttP42859 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HttP42859 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HttP42859 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HttP42859 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HttP42859 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HttP42859 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HttP42859 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HttP42859 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HttP42859 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
HttP42859 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
HttP42859 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HttP42859 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
HttP42859 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
HttP42859 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
HttP42859 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
HttP42859 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HttP42859 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
HttP42859 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
HttP42859 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HttP42859 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
HttP42859 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HttP42859 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HttP42859 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HttP42859 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
HttP42859 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms