Protein–RNA interactions for Protein: P41971

Elk3, ETS domain-containing protein Elk-3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elk3P41971 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elk3P41971 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elk3P41971 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Elk3P41971 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Elk3P41971 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Elk3P41971 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Elk3P41971 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Elk3P41971 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Elk3P41971 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Elk3P41971 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Elk3P41971 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Elk3P41971 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Elk3P41971 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elk3P41971 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Elk3P41971 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Elk3P41971 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Elk3P41971 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Elk3P41971 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elk3P41971 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Elk3P41971 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elk3P41971 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Elk3P41971 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms