Protein–RNA interactions for Protein: P41438

Slc19a1, Folate transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc19a1P41438 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc19a1P41438 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc19a1P41438 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc19a1P41438 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc19a1P41438 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc19a1P41438 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc19a1P41438 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc19a1P41438 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc19a1P41438 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc19a1P41438 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms