Protein–RNA interactions for Protein: P40240

Cd9, CD9 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd9P40240 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd9P40240 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cd9P40240 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd9P40240 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd9P40240 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd9P40240 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd9P40240 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cd9P40240 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cd9P40240 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cd9P40240 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd9P40240 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd9P40240 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cd9P40240 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cd9P40240 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd9P40240 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd9P40240 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cd9P40240 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms