Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Traf2P39429 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf2P39429 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf2P39429 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Traf2P39429 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Traf2P39429 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Traf2P39429 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Traf2P39429 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf2P39429 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Traf2P39429 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf2P39429 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Traf2P39429 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf2P39429 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Traf2P39429 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Traf2P39429 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms