Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Grik2P39087 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Grik2P39087 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik2P39087 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Grik2P39087 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Grik2P39087 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Grik2P39087 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Grik2P39087 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik2P39087 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik2P39087 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik2P39087 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik2P39087 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Grik2P39087 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Grik2P39087 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Grik2P39087 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik2P39087 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik2P39087 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Grik2P39087 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Grik2P39087 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grik2P39087 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Grik2P39087 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms