Protein–RNA interactions for Protein: P39061

Col18a1, Collagen alpha-1(XVIII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col18a1P39061 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Col18a1P39061 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Col18a1P39061 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Col18a1P39061 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Col18a1P39061 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Col18a1P39061 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Col18a1P39061 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Col18a1P39061 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Col18a1P39061 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Col18a1P39061 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.77
Col18a1P39061 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Col18a1P39061 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Col18a1P39061 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Col18a1P39061 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Col18a1P39061 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Col18a1P39061 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
Col18a1P39061 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Col18a1P39061 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Col18a1P39061 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Col18a1P39061 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Col18a1P39061 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col18a1P39061 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
Col18a1P39061 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Col18a1P39061 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col18a1P39061 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Col18a1P39061 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Col18a1P39061 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Col18a1P39061 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Col18a1P39061 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
Col18a1P39061 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
Col18a1P39061 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC32■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Col18a1P39061 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 228.3 ms