Protein–RNA interactions for Protein: P37238

Pparg, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PpargP37238 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PpargP37238 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PpargP37238 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PpargP37238 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpargP37238 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpargP37238 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpargP37238 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpargP37238 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpargP37238 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PpargP37238 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpargP37238 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PpargP37238 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PpargP37238 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PpargP37238 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PpargP37238 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PpargP37238 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PpargP37238 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PpargP37238 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PpargP37238 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PpargP37238 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PpargP37238 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PpargP37238 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PpargP37238 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PpargP37238 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PpargP37238 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PpargP37238 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PpargP37238 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PpargP37238 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PpargP37238 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PpargP37238 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PpargP37238 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PpargP37238 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PpargP37238 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PpargP37238 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PpargP37238 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PpargP37238 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpargP37238 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpargP37238 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PpargP37238 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpargP37238 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PpargP37238 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpargP37238 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpargP37238 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpargP37238 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpargP37238 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpargP37238 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpargP37238 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PpargP37238 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpargP37238 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpargP37238 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpargP37238 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpargP37238 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PpargP37238 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpargP37238 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpargP37238 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpargP37238 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpargP37238 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PpargP37238 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpargP37238 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpargP37238 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpargP37238 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpargP37238 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PpargP37238 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PpargP37238 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PpargP37238 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PpargP37238 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PpargP37238 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PpargP37238 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PpargP37238 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PpargP37238 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PpargP37238 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PpargP37238 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PpargP37238 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PpargP37238 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PpargP37238 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PpargP37238 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PpargP37238 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PpargP37238 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PpargP37238 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PpargP37238 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PpargP37238 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PpargP37238 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PpargP37238 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpargP37238 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpargP37238 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpargP37238 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpargP37238 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PpargP37238 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PpargP37238 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
PpargP37238 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PpargP37238 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpargP37238 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpargP37238 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpargP37238 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpargP37238 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpargP37238 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpargP37238 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpargP37238 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PpargP37238 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PpargP37238 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms