Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Saa4P31532 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Saa4P31532 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Saa4P31532 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Saa4P31532 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Saa4P31532 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Saa4P31532 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Saa4P31532 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Saa4P31532 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Saa4P31532 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Saa4P31532 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Saa4P31532 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Saa4P31532 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Saa4P31532 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Saa4P31532 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Saa4P31532 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms