Protein–RNA interactions for Protein: P30280

Ccnd2, G1/S-specific cyclin-D2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnd2P30280 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccnd2P30280 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ccnd2P30280 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccnd2P30280 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Ccnd2P30280 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ccnd2P30280 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms