Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Kif3aP28741 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Kif3aP28741 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.33■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Kif3aP28741 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Kif3aP28741 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Kif3aP28741 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms