Protein–RNA interactions for Protein: P28658

Atxn10, Ataxin-10, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn10P28658 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Atxn10P28658 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Atxn10P28658 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Atxn10P28658 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Atxn10P28658 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Atxn10P28658 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms