Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Xrcc5P27641 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Xrcc5P27641 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Xrcc5P27641 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Xrcc5P27641 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc5P27641 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Xrcc5P27641 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Xrcc5P27641 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
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