Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lmo2P25801 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lmo2P25801 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lmo2P25801 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Lmo2P25801 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms