Protein–RNA interactions for Protein: P23950

Zfp36l1, mRNA decay activator protein ZFP36L1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp36l1P23950 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Zfp36l1P23950 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Zfp36l1P23950 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Zfp36l1P23950 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Zfp36l1P23950 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms