Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csn1s1P19228 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csn1s1P19228 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Csn1s1P19228 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Csn1s1P19228 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Csn1s1P19228 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Csn1s1P19228 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms