Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rps6ka3P18654 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rps6ka3P18654 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rps6ka3P18654 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rps6ka3P18654 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms