Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rps6ka1P18653 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Rps6ka1P18653 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rps6ka1P18653 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rps6ka1P18653 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rps6ka1P18653 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 311.3 ms