Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P18530 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P18530 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P18530 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P18530 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P18530 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P18530 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P18530 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P18530 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P18530 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P18530 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P18530 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P18530 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P18530 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P18530 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P18530 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
P18530 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P18530 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P18530 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P18530 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P18530 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
P18530 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P18530 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P18530 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P18530 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P18530 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
P18530 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P18530 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P18530 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P18530 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
P18530 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P18530 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P18530 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P18530 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P18530 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P18530 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P18530 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
P18530 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P18530 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
P18530 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P18530 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P18530 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
P18530 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18530 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18530 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18530 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18530 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P18530 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P18530 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
P18530 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18530 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18530 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18530 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P18530 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P18530 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
P18530 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P18530 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18530 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18530 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18530 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18530 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18530 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P18530 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18530 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18530 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18530 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18530 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18530 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18530 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18530 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P18530 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18530 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18530 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18530 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18530 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18530 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P18530 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18530 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18530 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18530 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18530 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18530 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
P18530 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18530 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18530 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18530 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18530 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18530 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
P18530 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18530 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18530 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18530 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18530 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
P18530 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
P18530 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.2 ms