Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tgfb3P17125 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tgfb3P17125 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Tgfb3P17125 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tgfb3P17125 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tgfb3P17125 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms