Protein–RNA interactions for Protein: P15919

Rag1, V(D)J recombination-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rag1P15919 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rag1P15919 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rag1P15919 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rag1P15919 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rag1P15919 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rag1P15919 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rag1P15919 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rag1P15919 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rag1P15919 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rag1P15919 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Rag1P15919 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rag1P15919 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rag1P15919 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rag1P15919 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rag1P15919 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rag1P15919 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms