Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lmnb1P14733 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lmnb1P14733 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lmnb1P14733 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lmnb1P14733 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lmnb1P14733 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lmnb1P14733 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms