Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FosbP13346 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FosbP13346 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FosbP13346 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FosbP13346 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FosbP13346 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FosbP13346 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FosbP13346 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FosbP13346 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FosbP13346 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FosbP13346 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FosbP13346 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FosbP13346 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FosbP13346 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FosbP13346 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FosbP13346 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FosbP13346 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FosbP13346 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FosbP13346 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FosbP13346 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FosbP13346 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FosbP13346 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FosbP13346 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FosbP13346 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FosbP13346 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FosbP13346 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FosbP13346 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FosbP13346 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FosbP13346 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
FosbP13346 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
FosbP13346 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FosbP13346 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FosbP13346 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
FosbP13346 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
FosbP13346 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FosbP13346 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FosbP13346 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FosbP13346 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FosbP13346 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FosbP13346 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
FosbP13346 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FosbP13346 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FosbP13346 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FosbP13346 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FosbP13346 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FosbP13346 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FosbP13346 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FosbP13346 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FosbP13346 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FosbP13346 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FosbP13346 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FosbP13346 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FosbP13346 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FosbP13346 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FosbP13346 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FosbP13346 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FosbP13346 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FosbP13346 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FosbP13346 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FosbP13346 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FosbP13346 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
FosbP13346 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FosbP13346 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FosbP13346 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FosbP13346 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FosbP13346 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FosbP13346 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FosbP13346 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FosbP13346 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
FosbP13346 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FosbP13346 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FosbP13346 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FosbP13346 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FosbP13346 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FosbP13346 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FosbP13346 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FosbP13346 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
FosbP13346 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FosbP13346 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FosbP13346 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
FosbP13346 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FosbP13346 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FosbP13346 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
FosbP13346 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FosbP13346 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FosbP13346 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
FosbP13346 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FosbP13346 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FosbP13346 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FosbP13346 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
FosbP13346 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FosbP13346 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FosbP13346 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FosbP13346 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FosbP13346 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
FosbP13346 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FosbP13346 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
FosbP13346 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FosbP13346 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FosbP13346 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 314.8 ms