Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nr4a1P12813 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr4a1P12813 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nr4a1P12813 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Nr4a1P12813 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Nr4a1P12813 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nr4a1P12813 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nr4a1P12813 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.8 ms