Protein–RNA interactions for Protein: P11679

Krt8, Keratin, type II cytoskeletal 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt8P11679 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt8P11679 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Krt8P11679 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt8P11679 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt8P11679 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Krt8P11679 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt8P11679 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Krt8P11679 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt8P11679 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Krt8P11679 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt8P11679 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt8P11679 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Krt8P11679 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Krt8P11679 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms