Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prf1P10820 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Prf1P10820 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prf1P10820 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prf1P10820 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Prf1P10820 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Prf1P10820 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prf1P10820 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Prf1P10820 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prf1P10820 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prf1P10820 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Prf1P10820 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms