Protein–RNA interactions for Protein: P0DP28

Calm3, Calmodulin-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm3P0DP28 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Calm3P0DP28 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Calm3P0DP28 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Calm3P0DP28 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Calm3P0DP28 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Calm3P0DP28 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms