Protein–RNA interactions for Protein: P0C871

Pla2g4b, Cytosolic phospholipase A2 beta, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pla2g4bP0C871 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pla2g4bP0C871 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pla2g4bP0C871 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pla2g4bP0C871 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pla2g4bP0C871 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pla2g4bP0C871 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms