Protein–RNA interactions for Protein: P0C7N9

Psmg4, Proteasome assembly chaperone 4, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmg4P0C7N9 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Psmg4P0C7N9 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Psmg4P0C7N9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Psmg4P0C7N9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Psmg4P0C7N9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms