Protein–RNA interactions for Protein: P07744

Krt4, Keratin, type II cytoskeletal 4, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt4P07744 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt4P07744 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Krt4P07744 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt4P07744 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt4P07744 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Krt4P07744 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Krt4P07744 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt4P07744 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt4P07744 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt4P07744 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt4P07744 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Krt4P07744 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Krt4P07744 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 139.7 ms