Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P06324 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
P06324 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06324 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06324 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06324 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06324 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06324 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06324 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06324 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
P06324 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06324 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06324 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06324 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
P06324 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06324 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
P06324 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
P06324 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
P06324 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
P06324 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P06324 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
P06324 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
P06324 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P06324 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
P06324 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
P06324 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
P06324 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
P06324 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
P06324 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P06324 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P06324 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
P06324 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
P06324 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
P06324 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P06324 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P06324 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P06324 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
P06324 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P06324 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P06324 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
P06324 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
P06324 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
P06324 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P06324 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P06324 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P06324 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
P06324 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
P06324 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
P06324 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
P06324 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
P06324 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P06324 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P06324 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P06324 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P06324 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P06324 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P06324 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
P06324 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
P06324 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P06324 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P06324 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
P06324 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P06324 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P06324 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P06324 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
P06324 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
P06324 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P06324 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
P06324 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P06324 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
P06324 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P06324 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P06324 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
P06324 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
P06324 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P06324 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P06324 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
P06324 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
P06324 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P06324 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
P06324 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
P06324 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06324 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06324 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06324 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06324 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06324 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
P06324 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P06324 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P06324 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P06324 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P06324 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
P06324 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
P06324 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06324 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06324 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06324 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06324 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06324 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
P06324 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms