Protein–RNA interactions for Protein: P05627

Jun, Transcription factor AP-1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JunP05627 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
JunP05627 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
JunP05627 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
JunP05627 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
JunP05627 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
JunP05627 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
JunP05627 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
JunP05627 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
JunP05627 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
JunP05627 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
JunP05627 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
JunP05627 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
JunP05627 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
JunP05627 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
JunP05627 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
JunP05627 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
JunP05627 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JunP05627 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JunP05627 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JunP05627 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
JunP05627 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JunP05627 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JunP05627 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
JunP05627 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
JunP05627 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JunP05627 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
JunP05627 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
JunP05627 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
JunP05627 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
JunP05627 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
JunP05627 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JunP05627 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JunP05627 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
JunP05627 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JunP05627 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
JunP05627 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
JunP05627 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
JunP05627 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
JunP05627 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JunP05627 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JunP05627 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
JunP05627 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JunP05627 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JunP05627 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
JunP05627 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JunP05627 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
JunP05627 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
JunP05627 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JunP05627 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JunP05627 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JunP05627 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
JunP05627 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JunP05627 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
JunP05627 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
JunP05627 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
JunP05627 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
JunP05627 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JunP05627 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
JunP05627 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
JunP05627 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
JunP05627 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JunP05627 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JunP05627 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JunP05627 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
JunP05627 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
JunP05627 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JunP05627 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JunP05627 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
JunP05627 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
JunP05627 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JunP05627 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JunP05627 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
JunP05627 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
JunP05627 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JunP05627 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
JunP05627 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
JunP05627 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JunP05627 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JunP05627 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JunP05627 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JunP05627 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JunP05627 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
JunP05627 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
JunP05627 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
JunP05627 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
JunP05627 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
JunP05627 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
JunP05627 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
JunP05627 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JunP05627 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JunP05627 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JunP05627 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
JunP05627 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
JunP05627 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
JunP05627 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JunP05627 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JunP05627 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
JunP05627 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
JunP05627 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
JunP05627 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms