Protein–RNA interactions for Protein: P05622

Pdgfrb, Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfrbP05622 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PdgfrbP05622 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfrbP05622 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfrbP05622 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PdgfrbP05622 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PdgfrbP05622 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PdgfrbP05622 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PdgfrbP05622 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PdgfrbP05622 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms