Protein–RNA interactions for Protein: P04214

T-cell receptor beta chain V region E1, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04214 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
P04214 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
P04214 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
P04214 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
P04214 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
P04214 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
P04214 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
P04214 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
P04214 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
P04214 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
P04214 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
P04214 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
P04214 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P04214 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
P04214 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P04214 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P04214 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
P04214 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
P04214 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P04214 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
P04214 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
P04214 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P04214 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
P04214 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P04214 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
P04214 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
P04214 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
P04214 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
P04214 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
P04214 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
P04214 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P04214 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P04214 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
P04214 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P04214 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P04214 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
P04214 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
P04214 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
P04214 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P04214 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
P04214 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
P04214 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
P04214 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
P04214 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P04214 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
P04214 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P04214 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
P04214 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
P04214 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
P04214 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
P04214 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
P04214 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
P04214 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P04214 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
P04214 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P04214 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
P04214 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
P04214 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P04214 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P04214 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
P04214 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
P04214 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
P04214 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P04214 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
P04214 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P04214 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P04214 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P04214 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P04214 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
P04214 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P04214 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P04214 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P04214 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
P04214 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
P04214 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
P04214 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P04214 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P04214 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P04214 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
P04214 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
P04214 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
P04214 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
P04214 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
P04214 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
P04214 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
P04214 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
P04214 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
P04214 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
P04214 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
P04214 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P04214 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P04214 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P04214 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
P04214 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
P04214 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
P04214 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
P04214 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
P04214 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P04214 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
P04214 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 207.7 ms