Protein–RNA interactions for Protein: P02830

Hoxa7, Homeobox protein Hox-A7, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa7P02830 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Hoxa7P02830 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Hoxa7P02830 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Hoxa7P02830 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hoxa7P02830 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hoxa7P02830 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hoxa7P02830 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms