Protein–RNA interactions for Protein: P01878

Ig alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01878 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01878 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01878 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
P01878 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01878 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01878 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
P01878 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01878 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01878 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
P01878 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01878 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01878 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
P01878 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01878 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01878 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
P01878 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01878 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01878 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
P01878 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01878 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
P01878 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01878 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01878 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01878 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01878 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01878 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01878 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01878 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
P01878 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
P01878 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01878 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01878 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01878 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
P01878 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
P01878 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01878 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01878 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01878 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
P01878 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
P01878 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01878 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01878 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
P01878 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
P01878 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
P01878 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01878 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01878 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
P01878 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01878 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01878 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01878 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
P01878 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
P01878 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01878 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01878 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01878 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
P01878 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
P01878 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01878 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01878 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
P01878 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
P01878 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01878 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01878 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
P01878 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
P01878 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01878 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
P01878 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
P01878 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
P01878 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01878 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01878 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01878 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01878 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
P01878 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01878 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01878 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01878 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
P01878 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01878 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01878 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
P01878 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01878 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
P01878 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01878 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01878 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01878 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01878 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01878 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01878 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
P01878 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01878 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01878 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
P01878 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
P01878 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01878 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01878 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
P01878 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01878 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01878 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms