Protein–RNA interactions for Protein: P01843

Ig lambda-1 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01843 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01843 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01843 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01843 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01843 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01843 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01843 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01843 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01843 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01843 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01843 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01843 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01843 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01843 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01843 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
P01843 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01843 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01843 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01843 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01843 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01843 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01843 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01843 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01843 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01843 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01843 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01843 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01843 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01843 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01843 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01843 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01843 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01843 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01843 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01843 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01843 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01843 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01843 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01843 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01843 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01843 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01843 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01843 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01843 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01843 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01843 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01843 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01843 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01843 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01843 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01843 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01843 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01843 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01843 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01843 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01843 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01843 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01843 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01843 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01843 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01843 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01843 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01843 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01843 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01843 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01843 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01843 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01843 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01843 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01843 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01843 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01843 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01843 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01843 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01843 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01843 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01843 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01843 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01843 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01843 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01843 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01843 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01843 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01843 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01843 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01843 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01843 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01843 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01843 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01843 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01843 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01843 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01843 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01843 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01843 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01843 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01843 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01843 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01843 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01843 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms