Protein–RNA interactions for Protein: P01823

Ig heavy chain V region 36-60, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01823 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01823 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01823 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01823 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01823 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01823 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01823 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01823 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01823 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01823 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01823 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01823 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01823 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01823 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01823 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01823 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01823 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01823 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01823 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01823 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01823 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
P01823 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01823 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01823 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01823 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01823 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01823 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01823 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01823 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
P01823 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01823 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01823 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01823 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01823 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P01823 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01823 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01823 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01823 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P01823 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01823 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01823 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01823 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P01823 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01823 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01823 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P01823 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01823 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01823 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01823 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01823 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01823 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01823 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
P01823 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01823 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01823 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P01823 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01823 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01823 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01823 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01823 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01823 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01823 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01823 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P01823 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01823 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01823 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01823 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01823 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01823 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01823 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01823 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P01823 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01823 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01823 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01823 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01823 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01823 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P01823 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01823 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01823 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01823 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01823 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01823 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01823 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01823 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01823 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01823 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01823 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01823 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01823 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01823 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01823 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01823 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01823 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01823 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01823 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01823 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01823 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01823 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01823 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms