Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01748 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01748 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01748 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01748 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01748 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
P01748 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01748 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01748 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01748 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01748 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01748 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01748 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01748 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01748 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
P01748 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01748 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01748 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
P01748 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01748 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01748 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01748 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
P01748 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01748 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
P01748 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01748 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01748 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01748 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01748 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01748 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01748 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
P01748 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01748 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01748 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01748 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
P01748 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
P01748 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01748 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01748 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01748 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01748 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01748 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01748 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01748 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01748 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01748 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01748 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01748 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01748 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01748 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01748 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01748 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01748 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01748 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01748 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
P01748 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01748 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01748 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01748 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01748 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01748 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01748 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01748 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01748 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
P01748 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01748 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01748 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01748 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01748 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01748 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01748 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01748 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01748 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
P01748 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01748 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01748 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01748 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
P01748 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01748 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01748 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01748 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01748 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
P01748 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01748 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01748 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01748 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01748 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01748 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
P01748 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01748 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01748 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01748 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01748 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
P01748 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
P01748 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01748 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01748 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01748 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01748 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
P01748 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms