Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01658 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01658 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01658 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01658 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
P01658 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01658 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01658 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01658 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01658 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01658 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01658 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
P01658 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01658 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01658 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01658 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01658 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
P01658 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
P01658 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01658 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01658 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01658 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01658 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
P01658 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01658 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01658 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01658 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
P01658 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01658 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01658 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01658 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01658 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01658 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01658 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01658 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01658 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
P01658 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01658 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01658 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01658 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01658 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
P01658 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01658 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01658 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01658 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01658 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01658 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01658 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
P01658 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01658 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
P01658 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
P01658 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
P01658 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
P01658 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
P01658 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01658 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01658 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01658 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
P01658 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
P01658 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
P01658 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01658 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01658 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01658 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01658 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01658 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
P01658 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01658 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01658 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01658 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01658 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01658 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01658 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01658 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
P01658 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01658 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
P01658 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01658 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01658 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01658 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01658 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01658 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
P01658 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01658 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01658 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01658 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
P01658 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01658 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01658 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01658 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01658 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01658 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
P01658 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01658 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01658 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01658 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01658 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01658 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
P01658 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
P01658 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms