Protein–RNA interactions for Protein: P00848

Mtatp6, ATP synthase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtatp6P00848 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Mtatp6P00848 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Mtatp6P00848 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Mtatp6P00848 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Mtatp6P00848 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.2 ms