Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ccl20O89093 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccl20O89093 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
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Ccl20O89093 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccl20O89093 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccl20O89093 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
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