Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms