Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC30.15■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Apaf1O88879 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC30.11■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Apaf1O88879 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
Apaf1O88879 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Apaf1O88879 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Apaf1O88879 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Apaf1O88879 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms